Speaker
Description
Связь здоровья и видового состава микробиоты является одним из предметов научного интереса. В рамках данной работы изучался видовой состав кишечной микробиоты а) клинически здоровых лиц из популяции г. Красноярска, б) клинически здоровых лиц из популяции г. Омска, в) пациентов с ВЗК из г. Красноярска, г) пациентов с ВЗК из г. Омска, д) пациентов с рассеянным склерозом.
В результате выделения 16S рибосомальной РНК из образцов кала методом пиросеквенирования было получено 1220 образцов, таксономическое положение которых затем определялось с помощью метода [1] путём сравнения с 21195 генами 16S рибосомальной РНК из базы RDP. Кроме того, подобное сравнение было проведено посредством выравнивания.
Список используемой литературы:
[1] Highly Parallel Convolution Method to Compare DNA Sequences with Enforced In/Del and Mutation Tolerance / V. Shaidurov, E. Karepova, M. Sadovsky, A. Molyavko // Lecture Notes in Computer Science. – 2020. – Vol. 12108 LNBI. – P. 472-481. – DOI 10.1007/978-3-030-45385-5_42.
| Секция конференции | Биоинформатика и системная компьютерная биология |
|---|
